dnaman是一款由Lynnon Biosoft公司研发的综合性分子生物学序列分析程序。是一款高度一体化的应用软件,能够完成绝大多数常规的核酸与蛋白质序列分析任务,包括多重序列比对、PCR引物设计、限制性酶切图谱分析、蛋白质参数计算以及质粒图谱绘制等功能。依靠其快速的运算效率、丰富的功能配置、可靠的分析准确性以及稳定的输出质量,已是分子生物学研究者所信赖的基础软件之一。赶快下载使用吧!
dnaman使用教程
1、打开在本站下载好的DNAMAN软件,打开软件后,点击软件顶部的点击File,在弹出的选择中选择new

2、在新建好的对话框中输入DNA序列

3、输入完后,同时按住键盘上Ctrl和A,选中序列,并单击软件顶部“seq”图中以为大家标注出来。

4、然后点击软件顶部的Sequence选项,在弹出的选项中点击Display,在二级菜单中点击Rev.Compl.Sequence

5、然后就可以得到原序列的反向互补序列。

dnaman软件特色
1.DNA和蛋白质序列编辑
2.DNA序列转化
3.多序列比对、对齐编辑和分析
4.系统树分析
5.DNA或蛋白质序列的点阵比较
6.DNA序列组装和编辑
7.支持通过网络界面在Intranet/Internet Server上进行BLAST搜索
8.序列和数据库中的增强型图案搜索
9.SiRNA选择器
10.限制分析
11..绘制序列图(支持出版品质)
12.限制模式预测
13.电子克隆
14.从限制片段重建限制图
15.静音突变分析(创建/破坏限制性位点)
16.导向不匹配以创建/破坏限制站点
17.翻译和密码子使用分析
18.蛋白质疏水性/亲水性分析
19.蛋白质表征:序列组成和等电点预测
20.蛋白质二级结构预测
21.反向翻译
22.PCR和测序引物的设计
23.表征DNA或引物序列的热力学性质
24.分歧分析
25.管理寡核苷酸、DNA和蛋白质数据库
26.生成随机序列
dnaman软件功能
1.数据库管理:选择“数据库|经理”命令,即可打开“数据库管理器”对话框,便捷管理各类序列数据库;
2.DNA和蛋白质数据库:具备完善的数据库功能,允许按不同科目分类组织DNA和蛋白质序列;
3.编辑记录信息:支持编辑特定记录的相关信息,序列列表框中的所有记录可按字母顺序或记录顺序排列,每条记录名称旁会显示由DNAMAN自动分配的记录号(ID),因此可对不同记录使用相同名称;
4.扫描序列的相似性:可扫描默认数据库中的所有序列记录,搜索当前序列的同源序列。需注意,若默认数据库包含DNA序列,当前序列需为DNA序列;若默认数据库包含蛋白质序列,当前序列需为蛋白质序列。软件将采用快速对准方法扫描数据库序列相似性,可选择对结果最终输出采用快速对齐或最佳对齐方式;
5.错配分析:旨在找到引物与默认DNA序列中所有可能的退火位点,适用于PCR和DNA测序的引物选择。通过权重矩阵区分引物不同位置的重要性,由于引物3’末端与目标DNA的匹配对PCR扩增比5’末端更关键,因此3’末端被赋予更高权重。为提升PCR引物特异性,应通过此功能检查引物与靶DNA之间是否存在次级退火位点。